我会共主办了9个学术性刊物，分别是《Current Zoology》（《动物学报》）、《动物分类学报》、《动物学杂志》、《寄生虫与医学昆虫学报》、《兽类学报》、《蛛形学报》、《生物学通报》、《动物学研究》和《Chinese Birds》。几年来，在全体编委和编辑部人员的共同努力下，期刊质量有了较大幅度的提高，取得了可喜的成绩。《动物学报》自2009年更改英文刊，并于2010年被ISI、SCI 和Current Content收录。自2009年第5期开始，我会作为《动物学研究》的第二主办单位。《Avian Research》2009年6月获得新闻出版总署的批准，是我国首份正式鸟类学专业杂志。
　　各个刊物在工作中认真执行党和国家有关出版工作的各项方针政策和法律法规，严格把好刊物的质量关，注意编排格式的标准化和规范化，积极推进期刊的国际化。各刊在努力缩短论文发表周期、增补国际知名科学家参与期刊工作或撰写论文、培养青年学术骨干和学术带头人、将中文参考文献全部改为英文著录、促进中学生物学教育教学改革、网页的建立等方面分别做了大量的工作，收到了显著效果。现我会的刊物分别被多家国内外著名检索系统收录，这表明我会期刊的影响力有了不同程度的提高。 在我会《兽类学报》发表的“青藏铁路温性草原区铁路运营对啮齿动物群落结构的影响”论文荣获第六届中国科协期刊优秀论文二等奖。发表于《动物分类学报》 “苔藓动物主要类群28SrDNA多变区的分子形态分析及其系统学意义”、发表于《寄生虫与医学昆虫学报》 “旋毛虫Ts87重组蛋白诱发小鼠保护性免疫的研究”和发表于《动物学杂志》 “甘肃仓鼠分类地位再讨论”分别获三等奖。
　　《Current Zoology》（《动物学报》） （与中国科学院动物研究所合办）主编：孟安明
　　《动物学研究》（ZOOLOGICAL RESEARCH） （与中国科学院昆明动物研究所合办）主编：张亚平
　　《兽类学报》（ACTA THERIOLOGICA SINICA） （中国科学院西北高原生物研究所合办）主编：王德华
　　《蛛形学报》（ACTA ARACHNOLOGICA SINICA） （与湖大学合办）主编：陈 建
　　《动物分类学报》（ACTA ZOOTAXONOMICA SINICA） （与中国昆虫学会联合主办） 主编：李枢强
　　《寄生虫与医学昆虫学报》（Acta Parasitologica et Medica Entomologica Sinica) （与中国昆虫学会、军事医学科学院微生物流行病研究所联合主办） 主编：赵彤言
　　《动物学杂志》（Chinese Journal of Zoology） （与中国科学院动物研究所合办）主编：宋延龄
　　《生物学通报》（BULLETIN OF BIOLOGY） （与中国植物学会、北京师范大学联合主办） 主编：郑光美
　　《Avian Research》（与北京林业大学联合主办）主编：郑光美